碧玺和宝石的主要区别在于，碧玺和宝石的颜色不同，硬度不同，折射率不同，价值不同，重液鉴别，是否具有热电性，内部构造不同等。
颜色
碧玺的颜色有很多种，而红色宝石只有一种颜色，红色的碧玺颜色很丰富，从深红到粉红色是应有尽有。硬度
硬度也是分辨碧玺与红宝石的方法之一，碧玺的硬度不是很高，而红宝石的硬度仅次于钻石。
折射率
碧玺和宝石的折射率也是不一样的，在阳光下，红宝石会散发出一种美丽的荧光，碧玺就不会出现这种现象，用验钞机等紫外线等工具也能帮你鉴别。
价值
有颜色的碧玺的价格不是很高，要比红宝石便宜很多。
重液鉴别
可以用重液的方法鉴别，用一瓶3．06S／cm3的重液几颗石头同时放人重液中红碧玺悬浮或慢慢下沉，而红色黄玉、红色尖晶石则迅速下沉，红柱石下沉速度也大于红碧玺，由此可以挑出红碧玺。
碧玺最独特的特性就是它的热电性
在碧玺受热、摩擦或太阳的辐照下，其表面会带有电荷。这些电荷对空气中的异性电荷有相吸性，能吸附空气中带异性电荷的灰尘、纸屑等。这是其他宝石所不具有的。
碧玺是一种硼硅酸盐结晶体，含有铝、铁、镁、钠、锂、钾等化学元素，呈现各式各样的颜色。宝石指那种经过琢磨和抛光后,可以达到珠宝要求的石料或矿物。